松陰神社位於如今萩市（萩，音同「秋」）郊外松本村杉家的故地上。「杉」是吉田松陰（1830-1859）的本姓，他幼時名為杉虎之助，在此地出生、成長、育人，直至1859年被處決。
1890年，吉田松陰教學之地「松下村塾」被修復，附近還成建了一座小型紀念祠堂。17年後的1907年，他最著名的兩名學生、曾擔任過4任首相的伊藤博文（1841-1909）以及外交家兼官僚的野村靖（1842-1909），在他們以前聽過課的學校後方興建了松陰神社，以此紀念老師。

1936年至1940年間，捐款從日本各地湧入，用來資助興建一座新神社。建造工作在第二次世界大戰（1939-1945）期間曾經一度中斷，1955年，一座銅板屋頂的新神社終於竣工落成。2007年，在神社建成100週年之際，屋頂得以翻新。現在，人們把最初的神社建築稱為「松門神社」，依舊被保留在域內，專門用來祭祀吉田松陰的學生。
隨著時間推移，在江戶時代（1603-1867）的歷史建築四周建起了多處新建築，其中包括兩座博物館、多座展示吉田松陰和其他明治維新志士生平的建築物。

松陰神社外左側有一座大型石碑，為紀念1862年三位革命志士在此處會面而立，他們是薩摩藩（今鹿兒島縣）的田上藤七（生卒年不詳）、土佐藩（今高知縣）的坂本龍馬（1836-1867）以及萩藩（也叫「長州藩」，今山口縣）的久坂玄瑞（1840-1864）。三人會面的旅館，現已不復存在。

穿過神社的第一座鳥居（神社入口的牌坊式建築），左邊有一座紀念明治百年的大型石碑，立於1968年，刻有當時日本首相佐藤榮作（1901-1975）的題詞。佐藤榮作是山口縣人，曾獲得1974年諾貝爾和平獎。
再往前走幾步會看見一塊刻著詩句的小石碑，這首詩是吉田松陰在1859年被處決前所作，用來獻給他的父母。

松陰神社的中心是松下村塾和杉家舊宅。松下村塾被指定為國家史跡，並以「日本明治產業革命遺產」被列入聯合國教科文組織（UNESCO）世界遺產名錄；其後方的杉家舊宅是吉田松陰的故居，屬於典型的江戶時代低階武士住宅式樣；附近的至誠館內陳列著許多與吉田松陰相關的文物。

（此中文（繁體）解說文是在觀光廳的2024年度「地區觀光資源多語言解說創建支援事業」中，由中文（繁體）母語者編輯、翻譯製作而成。）